基于高通量测序技术分析2种菌草根际土壤真菌群落多样性

• 作者: Norvienyeku Justice 余文英 倪明月 叶文雨 胡红莉 许钰滢 谢序泽 鲁国东
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 菌草 根际土壤 真菌群落多样性 高通量测序
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 所属期刊栏目: 植物病理、作物病虫害及其防治
• 页码范围: 556-563
• 页数: 8页
• 分类号: Q938
• 字数: 5647字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2020.03.019

摘要

为了解福州菌草基地巨菌草和绿洲一号2种菌草的根际土壤真菌群落多样性,采用Illumina Miseq高通量测序技术和生物信息学方法,对菌草根际土真菌的多样性及群落结构进行分析.结果表明:从3份土壤样本中获得525292条ITS序列,在97％序列相似性基础上可划分为7267个可操作分类单元(OTU).真菌群落的丰富度指数(ACE)以菌草非根际土最低,绿洲一号根际土略高于巨菌草根际土;而多样性指数(Shannon-Wiener和Simpson)菌草根际土高于非根际土,绿洲一号根际土略高于巨菌草根际土.3份样品的优势菌门为子囊菌门(Ascomycota)、担子菌门(Basidiomycota)、接合菌门(Zygomycota)、壶菌门(Chytridiomycota)、球囊菌门(Glomeromycota);优势菌纲为散囊菌纲(Eurotiomycetes)、粪壳菌纲(Sordariomycetes)、座囊菌纲(Dothideomycetes)、伞菌纲(Agaricomycetes)、锤舌菌纲(Leotiomycetes)、圆盘菌纲(Orbiliomycetes)、银耳纲(Tremellomycetes)、粘膜菌纲(Wallemiomycetes);优势菌属为篮状菌属(Talaromyces)、深黄伞形霉属(Umbelopsis)、枝孢菌属(Cladosporium)、暗双孢菌属(Cordana)、镰刀菌属(Fusarium)、隐球菌属(Cryptococcus)、淡紫紫霉属(Purpureocillium)、赤霉菌属(Gibberella)、灵芝属(Ganoderma).研究结果表明,菌草根际土真菌群落多样性高于非根际土,为进一步更好地利用菌草提供理论参考依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	叶文雨		8	14	2.0	3.0
3	余文英	福建农林大学生命学院	23	163	9.0	12.0
4	胡红莉	福建农林大学植物保护学院	4	2	1.0	1.0
5	谢序泽	福建农林大学生命学院	3	1	1.0	1.0
6	许钰滢	福建农林大学生命学院	2	0	0.0	0.0
9	倪明月	福建农林大学植物保护学院	1	0	0.0	0.0
10	Norvienyeku Justice	福建农林大学生命学院	1	0	0.0	0.0