基于高通量测序对南极菲尔德斯半岛土壤微生物多样性的初步研究

• 作者: 宋易洋 李桂秀 王国良 赵芯
• 来源期刊: 渔业研究
• 学科: 生物学
• 关键词: 南极 土壤微生物 宏基因组 生物多样性 高通量测序
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 所属期刊栏目: 论文与报告
• 页码范围: 195-204
• 页数: 10页
• 分类号: Q938.2
• 字数: 3838字
• 语种: 中文
• DOI: 10.14012/j.cnki.fjsc.2020.03.001

摘要

南极地区环境恶劣、人迹罕至但微生物较为丰富,土壤中存在着极为丰富的微生物群落,这些土壤微生物为适应南极极端环境形成了独特的生物多样性、遗传机制和代谢途径.本文为了探究南极地区土壤微生物的生物多样性和群落结构,以中国第31次南极科学考察采自菲尔德斯半岛3 个站点的土壤样本作为研究对象,提取土壤微生物的宏基因组DNA,基于Illumina NovaSeq 6000测序平台和Paired-end 150测序策略进行高通量测序,通过生物信息学分析对南极土壤微生物的多样性进行了初步研究.使用MetaPhlAn2进行数据分析并用GraPhlAn对结果进行可视化,结果显示3例土壤样本中的微生物来自于8门14纲21目32科48属62种,其中假单胞杆菌属(Pseudomonas) 是优势细菌菌群,白色念珠菌(Can-dida albicans) 是优势真菌菌群.通过分析菲尔德斯半岛采集的样本,表明南极地区具有丰富的微生物种群多样性.本研究不仅有助于探究南极等极端环境中微生物的物种多样性,还为后期新菌的分离培养、活性物质的提取、功能基因的筛选、群落结构的研究等提供了实验依据和信息资源.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李桂秀	烟台大学生命科学学院	2	0	0.0	0.0
5	宋易洋	烟台大学生命科学学院	2	0	0.0	0.0
9	赵芯	北京市农林科学院北京农业生物技术研究中心	2	0	0.0	0.0
10	王国良	北京市农林科学院北京农业生物技术研究中心	2	0	0.0	0.0