温热带玉米株高的全基因组关联分析

• 作者: 刘小刚 徐孝洁 王山荭 郭子锋
• 来源期刊: 玉米科学
• 学科: 农学
• 关键词: 玉米 株高 全基因组关联分析
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·品种资源
• 页码范围: 31-36
• 页数: 6页
• 分类号: S513.035.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.13597/j.cnki.maize.science.20200105

摘要

以365份遗传背景丰富的玉米自交系为材料,采用自主研发的55K芯片,在海南三亚、河南新乡和北京顺义3个环境下对玉米自交系株高进行全基因组关联分析(Genome-wide association study,GWAS).结果 表明,株高在3个环境下变异非常丰富,有从低纬度到高纬度逐渐增加的趋势,株高在基因型、环境、基因型与环境互作方面均达极显著差异水平.全基因组关联分析表明,不同环境下均检测到与株高显著关联的位点,在第1、3、5、6、7、8号染色体上均发现了显著关联的SNP.新乡和顺义环境下,在bin5.05区段发现了显著关联的SNP;三亚和顺义环境下,在bin6.05区段发现了显著关联的SNP.对关联分析显著的SNP位点比对到B73参考基因组上,在maizeGDB网站上得到22个最可能的候选基因,为探索玉米株高遗传机制提供参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王山荭	中国农业科学院作物科学研究所	17	197	8.0	14.0
2	刘小刚	中国农业科学院作物科学研究所	6	30	2.0	5.0
3	郭子锋	中国农业科学院作物科学研究所	2	19	1.0	2.0
4	徐孝洁	中国农业科学院作物科学研究所	1	0	0.0	0.0