小檗碱对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌全基因组转录水平的影响研究

• 作者: 卢培 周芳芳 王微 王蕾
• 来源期刊: 中华检验医学杂志
• 关键词: 小檗碱 耐甲氧西林金黄色葡萄球菌 序列分析,RNA 基因表达谱
• 年，卷（期）: 2020,（5）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 576-581
• 页数: 6页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.cn114452-20191213-00724

摘要

目的 通过转录组测序(RNA-seq)分析小檗碱对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌USA300基因组表达谱的影响,研究小檗碱对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)的抑菌机制.方法 基础研究.本研究使用标准菌株USA300,该菌株为中科院上海药物所蓝乐夫课题组2019年所赠送.用1/2最低抑菌浓度(MIC)(64 mg/L)和1/8MIC(16 mg/L)浓度的小檗碱处理和无小檗碱处理耐甲氧西林金黄色葡萄球菌USA300,分析USA300差异基因表达情况.将差异基因筛选条件设为:P值＜0.05,且差异倍数＞2.采用SPSS 20.0进行统计分析.结果 通过测序结果发现,高浓度组与正常对照组相比,共有754个差异基因表达,其中上调基因主要为lukD、lukE、ssaA等,下调基因主要为lukF-PV、lukS-PV、clfA、splB～splF、sspA等;低浓度组与正常对照组相比,仅有19个差异基因表达,其中上调基因为speG、scpB、rpsQ等,下调基因为betA、bccT等.结论 本研究USA300转录组基因表达情况,了解经小檗碱作用后差异基因表达情况,推测小檗碱主要通过调控细菌细胞壁水解功能、白细胞毒素及其他毒力因子的表达发挥对MRSA的抑菌作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	卢培	上海市第八人民医院检验科	16	78	5.0	8.0
2	王蕾	上海市第八人民医院检验科	20	114	6.0	10.0
3	王微	上海市第八人民医院检验科	5	52	4.0	5.0
4	周芳芳	上海市第八人民医院检验科	6	16	2.0	4.0