Nanopore快速测序诊断饲养野猪非洲猪瘟疫情

• 作者: 任照文 何彪 涂长春 闫晓敏
• 来源期刊: 中国动物传染病学报
• 学科: 农学
• 关键词: 未知病原 纳米孔测序 非洲猪瘟 快速检测
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 简报
• 页码范围: 79-84
• 页数: 6页
• 分类号: S852.651
• 字数: 4480字
• 语种: 中文

摘要

为快速确诊内蒙古阿尔山地区突发的一起饲养野猪疫情,完成未知病原的检测与鉴定,从而迅速阻击疫情,本研究采用纳米孔(Nanopore)快速测序方法,在接到样品后150 min内检测出213条非洲猪瘟病毒(ASFV)序列,覆盖28.1％全基因组序列,迅速锁定该野猪疫情是由ASFV导致.为验证快速检测的准确性和可靠性,本研究进一步使用连接测序方案对该样品进行高通量测序,共获得9.0 G数据,包含1826条ASFV序列,拼接出99％的全基因组,测序深度为5.02×,进一步确认该疫情是ASFV引起.本研究通过纳米孔测序技术迅速处置突发野猪ASF疫情,实现疫情的早期监测与防控,对阻击病毒在野猪群体中的流行具有重要意义.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	涂长春	福建农林大学动物科学学院蜂学学院	56	449	12.0	18.0
3	何彪	军事医学研究院军事兽医研究所	4	38	2.0	4.0
4	任照文	军事医学研究院军事兽医研究所	2	0	0.0	0.0
5	闫晓敏	福建农林大学动物科学学院蜂学学院	1	0	0.0	0.0