南方拟微卫星标记筛选及遗传多样性分析

• 作者: 刘丽 刘佳豪 戴嘉格 李振海 李敏 杨永春 苏钰玲 邹柯姝 阮惠婷
• 来源期刊: 水产科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 南方拟 珠江流域 微卫星 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 研究与应用
• 页码范围: 224-233
• 页数: 10页
• 分类号: Q75
• 字数: 5670字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16378/j.cnki.1003-1111.2020.01.010

摘要

南方拟是一种分布于长江以南各水系的小型经济鱼类,目前仅有野生资源.为查明珠江流域其群体遗传结构现状,试验采用RAD-Seq技术筛选出36个多态性微卫星标记,其中29个为高度多态性(多态信息含量>0.50)位点,6个为中度多态性(0.25<多态信息含量<0.50)位点和1个为低度多态性(多态信息含量<0.25)位点.选取6个高度多态性位点研究珠江流域的北江、桂江、都柳江、融江、左江、右江、黔江及郁江8个江段南方拟群体的遗传多样性和种群分化情况,结果显示,共检测到98.17个等位基因,平均等位基因数、有效等位基因数、观测杂合度、期望杂合度、香农指数和多态信息含量值分别12.2713、6.0575、0.5389、0.7679、1.8974和0.7379,表明珠江流域南方拟的遗传多样性丰富.6个微卫星位点在8个群体中检测结果显示,平均群体间分化系数为0.1028,表明10.28％ 的遗传变异来自于群体间,89.72％ 的遗传变异来自于群体内,属于中等分化水平;平均群体内近交系数为0.2987,表明群体内杂合子缺失严重;基因流为1.0075～4.7308,说明群体间的基因流足以抵制遗传漂变.本研究的结果可为南方拟种质资源保护和开发利用提供科学依据.