比较基因组杂交技术分析结直肠癌远处转移的遗传变异

• 作者: 李华光 林谋斌 江慧洪 汤二将 汤绚 陈颖
• 来源期刊: 同济大学学报（医学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 结直肠癌 远处转移 比较基因组杂交 功能富集分析 DNA拷贝数改变
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 26-32
• 页数: 7页
• 分类号: R735.3+4
• 字数: 3947字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16118/j.1008-0392.2020.01.005

摘要

目的 应用微阵列比较基因组杂交技术分析结直肠癌远处转移的遗传变异.方法 收集47例结直肠癌患者(发生/未发生远处转移=18/29)的临床数据以及新鲜组织标本,进行微阵列比较基因组杂交分析,筛选出与远处转移相关的基因组改变.进行功能富集分析和蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络分析,探索结直肠癌远处转移的分子机制.结果 47例肠癌标本都存在广泛的遗传变异.研究发现,218个DNA拷贝数改变与结直肠癌的远处转移相关,且它们主要位于17q、22q、12p.功能富集分析显示这些基因组改变与免疫反应、Wnt信号通路、同源染色体重组、趋化因子信号通路和MAPK信号通路等密切相关.通过PPI网络分析获得了39个关键基因,包括TP53、EP300、MDM2、BRCA1、MAPK1等.结论 与结直肠癌远处转移相关的遗传变异主要位于17q、22q、12p,其基因组改变与免疫反应、Wnt信号通路、MAPK信号通路等密切有关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈颖	同济大学医学院胃肠外科和转化医学研究所	12	25	2.0	5.0
2	李华光	同济大学医学院胃肠外科和转化医学研究所	5	36	3.0	5.0
3	汤二将	同济大学医学院胃肠外科和转化医学研究所	2	10	1.0	2.0
4	林谋斌	同济大学附属杨浦医院普外科	17	39	4.0	6.0
8	汤绚	同济大学医学院	1	0	0.0	0.0
12	江慧洪	同济大学医学院	1	0	0.0	0.0