转录组分析不同砧木对嫁接烤烟抗青枯病的影响

• 作者: 刘斌祥 孔凡磊 罗延宏 袁继超 詹小旭 谢冰
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 农学
• 关键词: 烟草 嫁接 转录组 苯丙氨酸解氨酶 多酚氧化酶 病程相关蛋白
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 资源环境·植物保护
• 页码范围: 177-186
• 页数: 10页
• 分类号: S604|Q78
• 字数: 7067字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.20190870

摘要

为研究不同砧木对烟草嫁接苗抗病性的影响,明确抗病材料云烟87(Y87)作为砧木提高接穗红大金元(HD)对青枯病抗性的机理,采用劈接加生料带缠绕法以易感青枯病品种HD作为接穗,以HD和Y87作为砧木,分别构建HD/HD和HD/Y87嫁接烤烟苗,然后测量HD/HD和HD/Y87保护性酶苯丙氨酸解氨酶(PAL)活性的变化,最后利用高通量测序技术和Illumina HiSeqTM 4000测序平台,提取5株HD/HD或HD/Y87 mRNA,反转录构建总cDNA文库,测序,过滤低质量Reads后,用TopHat2比对参考基因组,用Cufflinks和DESeq软件获得基因表达量和差异表达基因.结果发现,不同取样时间HD/Y87 PAL活性均显著高于HD/HD,4个样品分别得到48414474～48697874条Clean Reads和38272～40938条基因,但HD/Y87发生选择性剪切事件数高于HD/HD;比较HD/Y87和HD/HD两组间基因表达量,得到3904条差异基因,其中3096条基因上调,808条基因下调;在上调基因中有参与木质素合成的3条编码苯丙氨酸解氨酶基因,5条Myb家族转录因子基因,5条编码多酚氧化酶基因;还有2条病程相关蛋白基因和3条相应的ERF转录因子基因等.这些结果表明,Y87作为砧木能够提高接穗HD PAL活性和多种抗性基因(包含木质素、多酚及病程相关蛋白)表达量,从而提高接穗红大金元对青枯病等病害抗性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	谢冰	四川农业大学农业农村部西南作物生理生态与耕作重点实验室	23	52	3.0	6.0
5	孔凡磊	四川农业大学农业农村部西南作物生理生态与耕作重点实验室	19	128	8.0	11.0
6	罗延宏		4	111	3.0	4.0
7	刘斌祥	四川农业大学农业农村部西南作物生理生态与耕作重点实验室	4	0	0.0	0.0
8	詹小旭	四川农业大学农业农村部西南作物生理生态与耕作重点实验室	1	0	0.0	0.0