人TCF7L2基因启动子生物信息学分析

• 作者: 鲍思元
• 来源期刊: 生物技术
• 学科: 医学
• 关键词: TCF7L2 启动子 转录因子 转录因子结合位点 生物信息学
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 所属期刊栏目: 技术与方法
• 页码范围: 44-51,58
• 页数: 9页
• 分类号: R394.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.16519/j.cnki.1004-311x.2020.01.0008

摘要

[目的]探讨人TCF7L2基因启动子特征.[方法]从UCSC数据库获得人TCF7L2基因5’调控区2 000 bp序列,利用多种在线软件对启动子、转录因子结合位点、CpG岛、SNP等进行分析.[结果]5’调控区2 000 bp序列正义链上至少存在5个潜在的启动子,其中-242～-192 bp、-853～-803bp之间可能包含核心启动子.查找到1个TATA盒,存在1个长度为499 bp的CpG岛.AliBaba2.1、PROMO和JASPAR软件分别预测到241、944、1 035(正义链)个转录因子结合位点.利用conreal程序在人和小鼠TCF7L2基因启动子保守区域内预测到207个共同的转录因子结合位点,涉及到66种转录因子.启动子区发现2个SNP位点.[结论]对人TCF7L2基因启动子进行了生物信息学分析,获得了启动子特征.