2019新型冠状病毒信息库

• 作者: 唐碧霞 宋述慧 朱军伟 李翠萍 李茹姣 王彦青 田东梅 章张 薛勇彪 赵文明 邹东 郝丽丽 陈梅丽 陈焕新 马利娜 马英克 鲍一明
• 来源期刊: 遗传
• 关键词: 冠状病毒数据库 2019新型冠状病毒 国家生物信息中心 国家基因组科学数据中心 基因组数据共享
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 资源与平台
• 页码范围: 212-221,中插6,中插7
• 页数: 12页
• 字数: 5414字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16288/j.yczz.20-030

摘要

2019年12月在中国武汉开始爆发的新型肺炎已造成全球25个国家/地区的31516人感染、638人死亡(截止2020年2月7日16时),引起该肺炎的病毒被世界卫生组织命名为2019新型冠状病毒(2019-nCoV).为促进2019-nCoV数据共享应用并及时向全球公众提供病毒的相关信息,国家生物信息中心(CNCB)/国家基因组科学数据中心(NGDC)建立了2019新型冠状病毒信息库(2019nCoVR,https://bigd.big.ac.cn/ncov).该信息库整合了来自德国全球流感病毒数据库、美国国家生物技术信息中心、深圳(国家)基因库、国家微生物科学数据中心及CNCB/NGDC等机构公开发布的2019-nCoV核苷酸和蛋白质序列数据、元信息、学术文献、新闻动态、科普文章等信息,开展了不同冠状病毒株的基因组序列变异分析并提供可视化展示.同时,2019nCoVR无缝对接CNCB/NGDC的相关数据库,提供新测序病毒株系的基因组原始测序数据、组装后序列的在线汇交、管理与共享、国际数据库同步发布等数据服务.本文对2019nCoVR数据汇交、管理、发布及使用等进行全面阐述,以方便用户了解该信息库各项功能及数据状况,为加速开展病毒的分类溯源、变异演化、快速检测、药物研发以及新型肺炎的精准预防与治疗等研究提供重要基础.