柯萨奇病毒B3型感染引起HeLa细胞内源性小干扰RNA的变化

• 作者: 史冰田 姚海兰 宋娟 宋芹芹 王欣玲 王瑞芳 韩俊
• 来源期刊: 微生物与感染
• 学科: 医学
• 关键词: 柯萨奇病毒B3型 HeLa细胞 内源性小干扰RNA
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 98-103
• 页数: 6页
• 分类号: R373|R34
• 字数: 3699字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-6184.2020.02.005

摘要

探究柯萨奇病毒B3型(Coxsackie virus type B3,CVB3)感染的细胞是否诱导内源性小干扰RNA(small interfering RNA,siRNA)的产生.以CVB3接种HeLa细胞,在细胞培养箱(5％CO2、37℃)孵育1 h.随后加入含2％血清的细胞维持液,继续培养3h和6h后收集细胞.用高通量测序(二代测序)试剂盒提取细胞RNA,并反转录合成cDNA,构建文库,上机测序.过滤数据,去除插入片段过长的序列、低质量序列、poly A序列和小片段序列,与已知的小RNA数据库比对鉴定siRNA.通过茎-环反转录-聚合酶链反应,证实内源性siRNA在感染CVB3后的表达.结果显示,感染CVB33 h和6 h后,HeLa细胞产生了多种内源性siRNA.其中内源性siRNA(novel_sir3502和novel_sir2806)在感染后3 h和6 h均可持续表达.经比对,novel_sir3502和novel_sir2806均可以识别45S和28S核糖体前体RNA.结果提示,CVB3感染可能干扰核糖体成熟.