许氏平鲉仔鱼、稚鱼、幼鱼肠道微生物群结构特征

• 作者: 史宝 姜燕 徐永江 曹亚男 李德军 柳学周 王滨
• 来源期刊: 水产科学
• 学科: 农学
• 关键词: 许氏平鲉 仔鱼 稚鱼 幼鱼 肠道微生物群 核心菌群
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 研究与应用
• 页码范围: 200-208
• 页数: 9页
• 分类号: S917.1
• 字数: 6409字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16378/j.cnki.1003-1111.2020.02.007

摘要

采集常规饲养的健康许氏平鲉1日龄仔鱼,9、20日龄稚鱼,54、95日龄幼鱼,运用IlluminaMiSeq PE300平台,对其肠道微生物的16S rDNA V3～V4可变区进行高通量测序,共获得1039个运算分类单位、667个属.在丰度高于1％ 的菌属水平上,野生鱼肠道菌群丰度的平均值(86％)远高于幼鱼时期的平均值(73.5％).不动杆菌属为仔鱼、稚鱼、幼鱼肠道中最优势菌属(丰度为26.2％ ～45.3％);短芽孢杆菌属次之.结合共有菌属分析获得11个核心菌群,芽孢杆菌属、短芽孢杆菌属、不动杆菌属、根瘤菌属等的丰度随仔鱼、稚鱼、幼鱼生长先升后降,均在54日龄时丰度最高;弧菌属则呈现相反的趋势(0.37％ ～12.41％),54日龄时丰度最低.仔鱼、稚鱼、幼鱼与野生个体肠道仅有14个共有菌属,短芽孢杆菌属、M assilia的最小丰度值分别是野生个体肠道中最大丰度值的9倍和32倍,差异明显.本研究揭示了许氏平鲉仔鱼、稚鱼、幼鱼肠道菌群结构特征及其发生、发育的过程,为苗种繁育阶段肠道生理健康调控提供理论依据.