利玛原甲藻PL11共附生菌多样性研究

• 作者: 李月月 樊成奇 田晓清 陆亚男 韩清华 马丽艳
• 来源期刊: 海洋渔业
• 学科: 生物学
• 关键词: 利玛原甲藻 腹泻性贝毒 共附生菌 高通量测序
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 73-81
• 页数: 9页
• 分类号: Q938.1
• 字数: 4946字
• 语种: 中文

摘要

为揭示产腹泻性贝类毒素(diarrheic shellfish poisoning,DSP)典型赤潮甲藻-利玛原甲藻(Prorocentrum lima)PL11的共附生菌群多样性信息,通过Illumina MiSeq高通量测序分析了PL11的共附生菌群种类及相对丰度,并且对其可培养共附生菌株进行了选择性分离及其16S rRNA基因序列扩增与系统发育的分析.利玛原甲藻PL11高通量测序结果显示:样品共附生细菌包括5门,14纲,26目,38科及54属.其中优势门(>5％)为3个,包括变形菌门(Proteobacteria,75.5％)、拟杆菌门(Bacteriodetes,11.5％)以及浮霉菌门(Planctomycetex,8.5％);优势纲(>5％)为4个,包括α-变形菌纲(Alphaproteobacteria,51.7％)、δ-变形菌纲(Deltaproteobacteria,31.8％)、鞘脂杆菌纲(Sphingobacteria,9.9％)以及OM190纲(8.9％);优势属(>5％)为6个,侏囊菌科下未知属(norank Nannocystaceae,21.8％)、Pyruvatibacte属(11.6％)、Phaeodactylibacter属(9.4％)、生丝单胞菌科下未知属(norank Hyphomonadaceae,8.5％)、OM190纲下未知属(8.1％)以及Roseovarius属(7.9％).从利玛原甲藻PL11培养物中分离获得可培养微生物菌株9株,分属于8个属,包括Ochrobactrum sp.(2株)及Microbacterium sp.、Algoriphagus sp.、Ponticoccus sp.、Hoeflea sp.、Labrenzia sp.、Sphingopyxis sp.、Erythrobacter sp.各1株.其中PL11-1为Ponticoccus属潜在新种.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陆亚男	中国水产科学研究院东海水产研究所	25	127	6.0	10.0
2	李月月		2	0	0.0	0.0
6	田晓清	中国水产科学研究院东海水产研究所	13	60	4.0	7.0
10	韩清华	中国水产科学研究院东海水产研究所	2	0	0.0	0.0
11	樊成奇	中国水产科学研究院东海水产研究所	17	84	6.0	9.0
12	马丽艳	中国水产科学研究院东海水产研究所	7	9	2.0	3.0