香蕉枯萎病菌1号小种分泌蛋白与效应子的预测与分析

• 作者: 何艳秋 李云锋 杨文静 王振中 聂燕芳 蒙姑 颜瑞
• 来源期刊: 植物病理学报
• 学科: 农学
• 关键词: 香蕉枯萎病菌1号小种 生物信息学 分泌蛋白 效应子 碳水化合物酶类
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 病原学
• 页码范围: 129-140
• 页数: 12页
• 分类号: S432.41
• 语种: 中文
• DOI: 10.13926/j.cnki.apps.000458

摘要

由尖孢镰刀菌古巴专化型1号小种(Fusarium oxysporumf.sp.cubense race 1,Foc1)引起的香蕉枯萎病是香蕉生产上的毁灭性病害之一.分泌蛋白作为一类重要致病因子,在Foc1与香蕉互作过程中起着重要作用.本文利用SignalP、WoLF PSORT、TargetP、TMHMM和big-PI Predictor等生物信息学软件,对Foc1全基因组编码的15 438条蛋白质氨基酸序列进行了分泌蛋白及效应子的预测分析.结果 表明,Foc1全基因组编码蛋白中有988个经典分泌蛋白,占编码蛋白总数的6.40％.蛋白特征分析表明,其氨基酸长度主要集中在101～500个氨基酸(占总数的71.26％),信号肽长度集中在17～20个氨基酸(占61.94％),信号肽切割位点以SPase Ⅰ型为主(占92.91％).碳水化合物酶类(CAZymes)分析表明,有281个分泌蛋白属于CAZymes,其中以糖苷水解酶家族最多.对细胞壁降解酶类分析表明,有27个分泌蛋白属于纤维素降解酶类,73个属于果胶降解酶类,42个属于木聚糖降解酶类.以氨基酸长度≤400和半胱氨酸残基数≥4为筛选条件,发现Foc1经典分泌蛋白中有378个候选效应子.qRT-PCR分析表明,7个候选效应子均在香蕉组织提取物诱导后获得上调表达,从实验角度证实了其为真正的效应子.