基于SNP芯片研究PI3K/Akt/mTOR通路上自噬相关基因SNPs与胃癌的关联

• 作者: 刘宝英 吴传城 吴晓丽 舒智雄
• 来源期刊: 癌变·畸变·突变
• 学科: 医学
• 关键词: PI3K/Akt/mTOR通路 自噬 单核苷酸多态性 胃癌
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 118-125
• 页数: 8页
• 分类号: R730.2
• 字数: 5646字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-616x.2020.02.007

摘要

目的:探讨与胃癌发生相关的PI3K/Akt/mTOR通路上新的与自噬相关基因单核苷酸多态性位点(SNPs),为寻找有价值的胃癌发生相关的分子标志物提供新的依据.方法:采用1:1配对病例-对照研究的方法.通过KEGG pathway网站和GeneOntology、Ensemble数据库及HaploView、STRING、Cytoscape软件联合SNP芯片筛选目标SNPs,采用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)对筛检出来的SNPs位点在来自福建省仙游县的622例胃癌患者和622例健康人群基因组中进行验证.结果:SNP芯片及生物信息学分析筛选出IRS1 rs 10205233、PIK3CD rs3934934、PIK3R1 rs706711、PIK3R1 rs706714和AKT1rs35285446为候选位点.扩大样本验证发现IRS1 rsi0205233的多态性变异(C＞T)显著降低了胃癌的发病风险[共显性模型、显性模型的0R(95％C1)分别为0.761(0.595,0.975)、0.764(0.601,0.973)].进一步分层分析,该位点显性模型、隐形模型、共显性模型以及等位基因在贲门癌和非贲门癌人群中均未见统计学差异(P＞0.05).并未见其他位点与患胃癌风险的关联有统计学意义.对PIK3R1基因2个位点(rs706711、rs706714)的单体型分析也未见统计学差异.结论:IRS1 rs10205233位点与福建省胃癌高发区仙游县的胃癌发生存在关联,T等位基因可能是胃癌发生的一个遗传保护因素.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘宝英	福建医科大学公共卫生学院	68	573	15.0	22.0
2	吴传城	福建医科大学公共卫生学院	18	40	4.0	6.0
3	舒智雄	福建医科大学公共卫生学院	1	0	0.0	0.0
4	吴晓丽	福建医科大学公共卫生学院	2	0	0.0	0.0