应用LDA模型的DNA序列分类方法

• 作者: 冯超
• 来源期刊: 福建电脑
• 学科: 工学
• 关键词: DNA序列 分类 特征表示 潜在狄利克雷分配
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 研究快报
• 页码范围: 35-37
• 页数: 3页
• 分类号: TP311
• 字数: 2182字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16707/j.cnki.fjpc.2020.02.008

摘要

DNA序列分类作为生物信息领域的一项基础任务,其目的是根据结构或功能的相似性来预测DNA序列所属的类别.本文在基于LDA(潜在狄利克雷分配)主题模型提出一种DNA序列主题特征表示方法,将基因序列转换为一组多个主题呈现度的概率向量.基于这种新的特征表示方法,构造了一种k-NN分类器对DNA序列进行分类.实验结果表明,新型特征表示方法提高了表示模型的学习效率,并且较为充分的反映DNA序列间的结构信息,从而有效提高了序列的分类精度.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	冯超	福建师范大学数学与信息学院	7	10	2.0	2.0