金黄色葡萄球菌在万古霉素中的表型可塑性

• 作者: 何晓青 戎梦迪 白珺 谢响明 郑旭阳 金一
• 来源期刊: 《福建农林大学学报（自然科学版）》
• 关键词: 表型可塑性 生长表型 双变量GWAS 金黄色葡萄球菌
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 资源与环境
• 页码范围: 223-230
• 页数: 8页
• 分类号: Q93-335
• 语种: 中文
• DOI: 10.13323/j.cnki.j.fafu(nat.sci.).2020.02.013

摘要

测定了41株金黄色葡萄球菌在无抗生素培养基和含4μg·mL-1万古霉素培养基中的生长曲线,基于双变量全基因组关联分析(GWAS)筛选与表型可塑性显著相关的SNP位点.将14个时间点的显著位点按照-logP值由大到小排列,并筛选出现频率较高且-logP值较大的SNP位点.最终得到9个显著SNPs:位点738836所在位置为非编码区;位点1394043和1871317所在基因编码假定蛋白;位点264897所在基因与药物转运蛋白有关;位点382501所在基因参与谷氨酸合成;位点2535773所在基因编码谷氨酸合酶亚基;位点615798和1842166所在基因分别编码H+反向转运蛋白亚基A和Ⅰ型限制修饰系统亚基;位点965494所在基因编码双功能自溶素.双变量GWAS分析表明,表型可塑性与氨基酸合成、离子转运等基因的调控密切相关,但与最低抑菌浓度没有直接关联.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	谢响明	北京林业大学生物科学与技术学院	66	635	13.0	22.0
2	何晓青	北京林业大学生物科学与技术学院	28	214	8.0	14.0
3	金一	北京林业大学生物科学与技术学院	12	62	4.0	7.0
4	郑旭阳	北京林业大学生物科学与技术学院	1	0	0.0	0.0
5	戎梦迪	北京林业大学生物科学与技术学院	1	0	0.0	0.0
6	白珺	北京林业大学生物科学与技术学院	1	0	0.0	0.0