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摘要:
浮游细菌在海洋生态系统中起到至关重要的作用.为了解舟山渔场细菌群落结构和菌群分型样本丰度,以及海洋生态因子和人类活动对细菌群落结构的影响.我们在舟山渔场设6个站位进行为期一年的采样,对全年样品进行16S rRNA高通量测序;利用序列间碱基的差异构建进化树.寻找同源性较高的序列进行对比,全年样品细菌16S rRNA克隆文库中相近微生物主要属于5个大类群:变形细菌,噬纤维菌属---黄杆菌类群,革兰氏阳性菌,革兰氏阳性菌.RDA结果表明细菌群落组成会随环境因子的变化而有所改变,其中放线菌与盐度呈明显的负相关关系,变形菌受温度的影响很大.通过Picrust功能性预测分析显示,舟山渔场近岸海域浮游细菌群落在氨基酸、碳水化合物的转运和代谢,核糖体结构、翻译转录等方面有较为突出的功能.本研究可以作为进一步舟山渔场近岸海域浮游细菌群落结构研究奠定基础.
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文献信息
篇名 东海舟山渔场近岸海域细菌群落结构分析
来源期刊 中国水运(下半月) 学科 生物学
关键词 细菌群落多样性及结构组成 16SrRNA高通量测序 系统进化树 RDA分析 Picrust功能预测
年,卷(期) 2020,(1) 所属期刊栏目
研究方向 页码范围 132-134
页数 3页 分类号 Q145
字数 3454字 语种 中文
DOI
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 赵淑江 11 100 4.0 10.0
2 刘强 5 7 2.0 2.0
3 杨铭玉 2 0 0.0 0.0
4 孟庆超 2 1 1.0 1.0
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研究主题发展历程
节点文献
细菌群落多样性及结构组成
16SrRNA高通量测序
系统进化树
RDA分析
Picrust功能预测
研究起点
研究来源
研究分支
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引文网络交叉学科
相关学者/机构
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中国水运(下半月)
月刊
1006-7973
42-1395/U
16开
湖北省武汉市
2008
chi
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