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东海舟山渔场近岸海域细菌群落结构分析
东海舟山渔场近岸海域细菌群落结构分析
作者:
刘强
孟庆超
杨铭玉
赵淑江
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
细菌群落多样性及结构组成
16SrRNA高通量测序
系统进化树
RDA分析
Picrust功能预测
摘要:
浮游细菌在海洋生态系统中起到至关重要的作用.为了解舟山渔场细菌群落结构和菌群分型样本丰度,以及海洋生态因子和人类活动对细菌群落结构的影响.我们在舟山渔场设6个站位进行为期一年的采样,对全年样品进行16S rRNA高通量测序;利用序列间碱基的差异构建进化树.寻找同源性较高的序列进行对比,全年样品细菌16S rRNA克隆文库中相近微生物主要属于5个大类群:变形细菌,噬纤维菌属---黄杆菌类群,革兰氏阳性菌,革兰氏阳性菌.RDA结果表明细菌群落组成会随环境因子的变化而有所改变,其中放线菌与盐度呈明显的负相关关系,变形菌受温度的影响很大.通过Picrust功能性预测分析显示,舟山渔场近岸海域浮游细菌群落在氨基酸、碳水化合物的转运和代谢,核糖体结构、翻译转录等方面有较为突出的功能.本研究可以作为进一步舟山渔场近岸海域浮游细菌群落结构研究奠定基础.
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文献信息
篇名
东海舟山渔场近岸海域细菌群落结构分析
来源期刊
中国水运(下半月)
学科
生物学
关键词
细菌群落多样性及结构组成
16SrRNA高通量测序
系统进化树
RDA分析
Picrust功能预测
年,卷(期)
2020,(1)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
132-134
页数
3页
分类号
Q145
字数
3454字
语种
中文
DOI
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作者信息
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姓名
单位
发文数
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赵淑江
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中国水运(下半月)
主办单位:
中华人民共和国交通部
出版周期:
月刊
ISSN:
1006-7973
CN:
42-1395/U
开本:
16开
出版地:
湖北省武汉市
邮发代号:
创刊时间:
2008
语种:
chi
出版文献量(篇)
20681
总下载数(次)
38
总被引数(次)
41402
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