低温胁迫对意大利蜜蜂化蛹时差异可变剪接基因的影响

• 作者: 周冰峰 周姝婧 姚丹 徐新建 朱翔杰
• 来源期刊: 《福建农林大学学报（自然科学版）》
• 关键词: 低温 意大利蜜蜂 可变剪接 发育
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 动物科学
• 页码范围: 217-222
• 页数: 6页
• 分类号: S891
• 语种: 中文
• DOI: 10.13323/j.cnki.j.fafu(nat.sci.).2020.02.012

摘要

基于前期低温胁迫3日龄封盖子不同时间的转录组数据,对可变剪接基因(ASG)作数量、种类统计和表达谱等分析,进一步解释低温对蜜蜂化蛹影响的分子机制;同时利用rMATS软件及Omicshare在线工具对T18、T36处理组(在20℃低温下分别处理18和36 h)及CK(没有低温处理)的差异基因进行可变剪接(AS)事件分析.结果表明,在各组别(CK与T18、CK与T36、T18与T36)中鉴定出4971个ASG,产生58017个AS事件,以外显子跳跃、外显子选择性跳跃和可变3'端剪接3种剪接类型为主.各组别间的共有ASG为4027个,其基因本体(GO)分类结果显示,这些ASG富集在41条GO条目上;KEGG代谢通路富集分析显示,这些ASG共富集在132条代谢通路上,极显著富集的有Wnt、Hippo、TGF-beta和胞吞作用等信号通路.上述结果表明,低温胁迫可通过ASG介导代谢、生长发育和免疫等多重功能调控蜜蜂的化蛹过程.