双线紫蛤COI基因序列多态性与水环境分析

• 作者: 王朋云
• 来源期刊: 渔业研究
• 学科: 农学
• 关键词: 双线紫蛤 COI基因 序列多态性 栖息地水环境
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 论文与报告
• 页码范围: 324-338
• 页数: 15页
• 分类号: S917.4
• 字数: 9508字
• 语种: 中文
• DOI: 10.14012/j.cnki.fjsc.2020.04.004

摘要

以双线紫蛤(Soletellina diphos)为研究对象,测定南日岛海区自然群体30枚个体的线粒体COI基因部分序列,研究其个体间的序列单核苷酸多态性(SNP),掌握双线紫蛤的遗传多样性;统计南日岛海域2008年4月-2018年12月期间海水样品的盐度、温度、pH、溶解氧、叶绿素a、透明度、化学需氧量、无机氮、无机磷、石油类10项理化因子检测结果,分析数据随季节月份变化状况,了解双线紫蛤栖息地水环境.结果 显示,南日岛双线紫蛤群体30枚个体的序列中碱基T、C、A、G平均含量分别为41.95％、16.07％、18.53％、23.45％,(A+T)含量明显高于(G+C)含量,共发现13个核苷酸多态位点(转换/颠换偏倚率13.04),具有9个单倍型,有1个为引起亮氨酸/苯丙氨酸变化的非同义突变位点,单倍型多样性指数(Hd)为(0.598 0±0.103 0),核苷酸多样性(Pi)为(0.002 9±0.000 6),平均核苷酸变异数(k)为1.912 6,表现出略高于标准值的单倍型多样性和较低的核苷酸多样性,个体间的遗传距离为0 ～0.009 2、平均值为(0.002 9±0.001 0),Tajima's D和Fu's Fs中性检验的结果均为不显著负值,说明这个群体的双线紫蛤遗传相对稳定.南日岛产区水环境月均盐度变化范围为26.84 ～ 34.33、温度变化范围为13.27 ～29.33℃、pH变化范围为7.89 ～8.54、溶解氧变化范围为5.64 ～9.31 mg/L、叶绿素a变化范围为0.33 ～ 15.57 μg/L、透明度变化范围为0.40 ～1.79m、化学需氧量变化范围为0.22～ 1.59 mg/L、无机氮变化范围为0.04 ～0.45 mg/L、无机磷变化范围为0～0.16 mg/L、石油类变化范围为0 ～0.20 mg/L,盐度、温度在各年春、夏、秋三季变化皆先升后降,夏季最高;pH、溶解氧则在春、夏两季波动呈下降;而无机氮在春、夏、秋季趋势为先降后升,夏季最低;除了化学需氧量和石油类以外,其余参数的周年变动均表现出一定的季节性差异规律,同时表明双线紫蛤在以上的理化条件下都可以进行生长繁殖.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王朋云		6	6	1.0	2.0