草地贪夜蛾雄性成虫和5龄幼虫的转录组比较分析

• 作者: 廖永林 李燕芳 杨斌 王继华 蔡时可 赵华 陈伟平 高燕
• 来源期刊: 昆虫学报
• 学科: 农学
• 关键词: 草地贪夜蛾 发育阶段 嗅觉基因 转录组 基因注释 生物信息学
• 年，卷（期）: 2020,（5）
• 所属期刊栏目: 生理与生化
• 页码范围: 523-532
• 页数: 10页
• 分类号: S763.38
• 语种: 中文
• DOI: 10.16380/j.kcxb.2020.05.001

摘要

[目的]草地贪夜蛾Spodoptera frugiperda是一种新近入侵我国的重要害虫.本研究旨在对草地贪夜蛾雄性成虫和5龄幼虫两个不同发育阶段的转录组进行比较分析.[方法]利用高通量测序技术对草地贪夜蛾雄性成虫和5龄幼虫进行转录组测序和数据组装,并对转录组数据进行功能注释和比较分析.[结果]经de novo组装共获得209 002条转录本,平均长度为687.55 bp,N50为982 bp.共有46 198条(57.43％)unigene在至少一个数据库中获得功能注释,其中1 713条(2.13％)unigene在所有数据库中均能获得注释.在GO数据库中获得205 269条unigene的注释,主要包括68个功能分类;在KEGG数据库中共有3 408条unigene得到注释,涉及277个代谢通路.共鉴定到424个嗅觉相关的基因,并且在雄性成虫和5龄幼虫之间的表达存在差异.通过比较转录组分析,在雄性成虫中鉴定到9 162个上调和6 399个下调差异表达基因(DEGs);功能富集分析发现在上调DEGs中涉及信息素以及信号转导的代谢通路显著富集,而下调DEGs中涉及解毒相关的通路显著富集.[结论]这些转录组数据为探究草地贪夜蛾的生长发育、嗅觉相关功能基因以及候选分子靶标提供资源信息.