适用于转录组测序的大蒜花器官总RNA的提取方法

• 作者: 刘晓颖 尚云涛 曹宝鑫 王振英 范宝莉 陈雅楠
• 来源期刊: 天津师范大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 大蒜 花器官 RNA提取 改进酸性异硫氰酸胍法 转录组测序
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 所属期刊栏目: 生命科学
• 页码范围: 34-39
• 页数: 6页
• 分类号: S633.4|Q522
• 字数: 4992字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19638/j.issn1671-1114.20200107

摘要

为获得高质量的大蒜花器官RNA以用于后续花发育相关基因的研究,以大蒜中多糖多酚含量高的鳞茎为初步实验材料,采用2种试剂盒方法、CTAB法、Trizol法以及改进酸性异硫氰酸胍法提取总RNA,并对提取效果进行比较,筛选出能够得到高质量RNA的天根试剂盒方法和改进酸性异硫氰酸胍法.将改进酸性异硫氰酸胍法进一步用于提取大蒜花器官总RNA,相较于试剂盒方法,获得了质量更好、收率更高的RNA.对提取的大蒜花器官RNA进行完全测序,得到的clean reads占总raw reads比例大于98％,能够满足转录组测序分析的要求.