广东省主要红树林植物DNA条形码评价

• 作者: 姜仲茂 廖宝文 李玫 武锋 管伟 裴男才
• 来源期刊: 东北林业大学学报
• 关键词: DNA条形码 红树林 物种识别 系统发育关系
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 页码范围: 42-49
• 页数: 8页
• 分类号: S718.4-3|Q949.4
• 语种: 中文

摘要

为评估DNA条形码对鉴定红树林植物的通用性和有效性,在广东红树林分布区域共计采集红树林植物16科22属23种,共144个样品,并进行DNA条形码测序.结果表明:选择的rbcL、matK和trnH-psbA 3个DNA片段的PCR扩增成功率分别为100％、80.29％±8.49％、99.38％±1.25％.测序成果率最高为rbcL 100％,trnH-psbA次之94.57％±5.06％,matK最低75.04％±6.26％.表明rbcL和trnH-psbA片段在红树林群落中都具有较好的通用性.应用BLAST和NJ Tree两种方法计算红树植物的物种识别率.BLAST结果表明,单片段中trnH-psbA的物种识别率最高,为84.48％±12.09％,rbcL次之,matK最低.NJ Tree分析显示单片段中rbcL的物种识别率最高,为66.65％±17.35％;trnH-psbA片段次之,matK片段最低.两张分析方法都显示多个片段组合使用时,rbcL或trnH-psbA是提高物种平均识别率的主要片段.利用单片段rbcL即可获得平均节点支持率最高的红树植物系统发育树,且能准确区分不同树种.trnH-psbA片段可以识别rbcL片段不能识别的物种,可以作为补充片段.综合比较,推荐rbcL、trnH-psbA作为红树林植物DNA条形码片段.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	管伟	中国林业科学研究院热带林业研究所	46	444	14.0	18.0
2	廖宝文	中国林业科学研究院热带林业研究所	111	1721	25.0	36.0
3	李玫	中国林业科学研究院热带林业研究所	45	721	15.0	26.0
4	裴男才	中国林业科学研究院热带林业研究所	16	91	6.0	9.0
5	姜仲茂	中国林业科学研究院热带林业研究所	13	46	4.0	6.0
6	武锋	中国林业科学研究院热带林业研究所	10	37	3.0	6.0