狗头枣GSTU基因的克隆及其序列分析

• 作者: 何亚蓉 常勇 张睿 赵赞延 陈国梁 陈宗礼
• 来源期刊: 分子植物育种
• 关键词: 狗头枣 GSTU基因 基因克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 基因组学及功能基因
• 页码范围: 394-400
• 页数: 7页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13271/j.mpb.018.000394

摘要

为探索红枣GSTU类基因在红枣抗逆中的分子作用机制,本研究以狗头枣枣树叶片的DNA为模板,根据枣GSTU基因的序列(HM345954.1)设计引物,采用PCR方法获得GSTU基因序列,并利用生物信息学手段对其所对应蛋白的结构域、功能域、理化特性、跨膜区、二级结构及亚细胞定位等进行分析.结果 表明:克隆到的DNA序列全长838 bp,具有2个外显子和1个内含子,内含子在292～460 bp碱基处,该序列与GenBank中枣的GSTU核苷酸序列和氨基酸序列的同源性分别为99.85％和100％,表明成功的克隆了狗头枣的GSTU基因.该序列编码222个氨基酸,分子量为25.268 kD,理论等电点(pI)为6.10;亲水性的平均数为-0.242,表明该蛋白是亲水性蛋白.二级结构主要以α-螺旋为主,其次是无规则卷曲,不存在信号肽,表明该蛋白可能为非分泌性蛋白,该蛋白可能位于内质网(膜)和质膜上.本研究获得的狗头枣GSTU基因在基因结构上含有1个内含子,在核酸序列及氨基酸序列上与GenBank中枣的GSTU基因同源性高,并对其理化性质、结构等进行了预测与分析,为进一步研究红枣抗逆分子机制提供理论基础,同时为红枣品种的选育提供理论支持.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈国梁		81	440	11.0	18.0
2	陈宗礼		80	698	15.0	23.0
3	张睿		3	1	1.0	1.0
4	赵赞延		5	0	0.0	0.0
5	何亚蓉		2	0	0.0	0.0
6	常勇		1	0	0.0	0.0