辣椒抗坏血酸生物合成酶GME基因家族的鉴定和表达分析

• 作者: 张国斌 秦启杰 罗建 车旭升
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 农学
• 关键词: 辣椒 抗坏血酸 GME基因家族 表达分析
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·生物技术
• 页码范围: 71-78
• 页数: 8页
• 分类号: Q78|S641.03
• 字数: 5435字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.20190723

摘要

GDP-甘露糖-3′,5′-异构酶基因(GME)是抗坏血酸途径中的关键限速酶,该基因可以调节AsA合成.为了解辣椒中GME基因家族功能及在非生物胁迫下的表达情况,通过生物信息学方法对辣椒GME基因家族进行鉴定,并对基因结构、结构域、系统进化关系、基因表达模式和非生物胁迫表达情况进行分析.结果表明,在辣椒中有2个GME家族成员,CaGME1和CaGME2,分别分布在3号和8号染色体上,都有6个外显子;CaGME1和CaGME2蛋白均具有NADB Rossmann家族中高度保守的NADPH结合位点、底物特异性结合位点,均不具有信号肽,为亲水性蛋白,定位在细胞质粒的可能性最高,均不具有跨膜结构,二级结构主要以不规则卷曲和α-螺旋为主;系统进化树分析表明,该基因编码的氨基酸序列与番茄和马铃薯的亲缘关系最近;qRT-PCR分析结果表明,在低温、茉莉酸甲酯和盐胁迫下CaGME1和CaGME2均被诱导上调,在赤霉素下均被诱导下调.综上可知,CaGME1和CaGME2基因在胁迫下不同的表达情况表明其在非生物胁迫中发挥作用,可为辣椒逆境胁迫机制研究提供参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张国斌	甘肃农业大学园艺学院	86	1603	21.0	38.0
2	车旭升	甘肃农业大学园艺学院	4	0	0.0	0.0
3	秦启杰	甘肃农业大学园艺学院	4	0	0.0	0.0
4	罗建	甘肃农业大学园艺学院	5	1	1.0	1.0