基于数据挖掘分析LUM基因在胃癌中的表达及意义

• 作者: 彭帅 李慧敏 沈磊 王珊珊 田敏秀
• 来源期刊: 肿瘤预防与治疗
• 学科: 医学
• 关键词: 胃癌 LUM 数据挖掘 Oncomine UALCAN
• 年，卷（期）: 2020,（7）
• 所属期刊栏目: 临床研究
• 页码范围: 561-566
• 页数: 6页
• 分类号: R735.2|R73-36
• 字数: 3296字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-0904.2020.07.003

摘要

目的:通过数据库分析LUM基因在胃癌中的表达情况及意义.方法:通过Oncomine数据库分析LUM基因在胃癌中的差异性表达,基于GEPIA网站分析LUM基因表达与胃癌患者生存周期的关系;同时利用MethHC数据库分析LUM基因甲基化水平,使用基于TCGA数据集的UALCAN在线数据库对LUM在胃癌患者中的表达及预后进行验证;并通过String数据库分析LUM基因的蛋白相互作用及上下游调控关系.结果:胃癌组织中LUM的mRNA表达较正常对照组明显增高;Meta分析进一步证实LUM基因的表达在胃癌组织中明显增高.GEPIA分析发现高表达组患者生存周期明显短于低表达组(P<0.05).与此同时,甲基化分析中得出LUM基因甲基化水平肿瘤组明显高于正常组;TCGA数据集验证显示LUM在胃癌组织中的表达量与预后有关;蛋白质网络分析得出,LUM可能与OGN、CHST1、CHST5、CHST6、DCN、COL1A1、COL1A2、COL3A1、COL4A2、ACAN等蛋白相互作用.结论:基于多个数据库的数据挖掘发现,LUM基因在胃癌组织中呈现高表达,且其表达水平与胃癌患者总体生存相关;LUM是与胃癌预后相关的生物标志物,参与肿瘤的发生发展,或可作为诊断和治疗的潜在靶点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	沈磊	武汉大学人民医院消化内科	116	551	13.0	17.0
2	李慧敏	武汉大学人民医院消化内科	29	118	5.0	10.0
3	王珊珊	武汉大学人民医院消化内科	13	58	4.0	7.0
4	田敏秀	武汉大学人民医院消化内科	4	0	0.0	0.0
5	彭帅	武汉大学人民医院消化内科	4	4	1.0	2.0