氨基酸性质与蛋白质二级结构的相关分析

• 作者: 王世锋 詹建立
• 来源期刊: 生物技术
• 学科: 生物学
• 关键词: 氨基酸性质 相关性 蛋白质二级结构
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 技术与方法
• 页码范围: 156-160
• 页数: 5页
• 分类号: Q518.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.16519/j.cnki.1004-311x.2020.02.0026

摘要

[目的]统计48种氨基酸性质之间的相关性并分析其对蛋白质二级结构的影响.[方法]用r软件对20种氨基酸性质进行分析.[结果]侧链二面角角度柔性等3种性质与Pα相关系数为0.412、0.832、0.477等,以正相关影响α-螺旋的形成,而可压缩系数与Pα相关系数为-0.293,以负相关影响其形成;疏水介热性等17种性质与Pβ的相关系数为0.536、0.867等,以正相关影响β-折叠的形成,而氨基酸极性等6种性质与Pβ的相关系数为-0.547等,以负相关影响其形成;均方根起伏位移与Pt、Pc的相关系数为0.742、0.73,以正相关影响β-转角和无规则卷曲的形成,而膨松度等19种性质与Pt、Pc的相关系数为-0.635、-0.626等,以负相关影响二者的形成.[结论]氨基酸本身信息对蛋白质二级结构有正或负相关的影响.