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绵羊DIO2基因组织表达及其多态性与产羔数关联分析
绵羊DIO2基因组织表达及其多态性与产羔数关联分析
作者:
储明星
安雪姣
张仁森
潘章源
田志龙
蔡原
赵生国
马琳
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
绵羊
DIO2基因
组织表达
SNP分型
季节性繁殖
产羔数
摘要:
[目的]本试验旨在探明Ⅱ型脱碘酶(DIO2)基因在常年发情的小尾寒羊和季节性发情的草地型藏羊中的表达模式,并探讨其多态性与绵羊季节性繁殖和产羔数之间的关系. [方法]通过荧光定量PCR( qPCR)检测DIO2基因在不同品种绵羊的10种组织中的表达,同时利用SNP技术对3个常年发情绵羊品种(小尾寒羊、策勒黑羊和湖羊)和3个季节性发情绵羊品种(滩羊、苏尼特羊和草地型藏羊)的DIO2基因2个SNP 位点多态性进行检测,并与小尾寒羊产羔数进行关联分析. [结果]qPCR结果显示,DIO2基因在小尾寒羊和草地型藏羊各组织中广泛表达,其中草地型藏羊下丘脑、垂体、卵巢、子宫和输卵管组织中的表达量显著高于小尾寒羊(P<0.05).基因分型结果表明,绵羊DIO2基因g.88484603G>C位点基因型频率和等位基因频率在季节性发情和常年发情绵羊品种间差异均达到极显著水平(P<0.01).群体遗传学分析表明,绵羊DIO2基因g.88484594T>C位点在滩羊和策勒黑羊中表现为中度多态(0.25<PIC<0.5),在其他4个群体中均表现为低度多态(PIC<0.25);g.88484603G>C位点在这6个绵羊群体中均表现为中度多态(0.25<PIC<0.5).卡方适合性检验结果表明,g.88484594T>C位点在这6个群体中均处于哈代温伯格不平衡状态(P<0.05),g.88484603G>C位点在这6个绵羊品种中均处于哈代温伯格平衡状态(P>0.05).生物信息学分析表明,g.88484603G>C位点突变前、后的mRNA二级结构发生了改变,而且其最小结构自由能降低,结构稳定性增强,蛋白质二级结构没有发生变化,但三级结构有一些变化.关联分析表明,这2个SNP位点与小尾寒羊前3胎产羔数均无显著关联(P>0.05). [结论] DIO2基因与绵羊的季节性繁殖密切相关,其g.88484603G>C位点对绵羊季节性繁殖性状有一定的调控作用.
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文献信息
篇名
绵羊DIO2基因组织表达及其多态性与产羔数关联分析
来源期刊
南京农业大学学报
学科
农学
关键词
绵羊
DIO2基因
组织表达
SNP分型
季节性繁殖
产羔数
年,卷(期)
2020,(1)
所属期刊栏目
动物科学
研究方向
页码范围
134-142
页数
9页
分类号
S826.2
字数
6125字
语种
中文
DOI
10.7685/jnau.201811020
五维指标
传播情况
被引次数趋势
(/次)
(/年)
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引文网络
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研究主题发展历程
节点文献
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DIO2基因
组织表达
SNP分型
季节性繁殖
产羔数
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
南京农业大学学报
主办单位:
南京农业大学
出版周期:
双月刊
ISSN:
1000-2030
CN:
32-1148/S
开本:
大16开
出版地:
南京市卫岗1号
邮发代号:
28-53
创刊时间:
1956
语种:
chi
出版文献量(篇)
2940
总下载数(次)
5
总被引数(次)
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