基于线粒体D-loop的西江流域粗唇鮠群体遗传多样性分析

• 作者: 何安尤 吴伟军 彭敏 施军 李育森 王大鹏 雷建军 韩耀全
• 来源期刊: 淡水渔业
• 学科: 农学
• 关键词: 粗唇鮠(Leiocassis crassilabris) D-loop 遗传多样性 西江流域
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 页码范围: 3-9
• 页数: 7页
• 分类号: S917.4
• 字数: 4808字
• 语种: 中文

摘要

为研究西江流域粗唇鮠(Leiocassis crassilabris)种群遗传多样性,以采自西江流域7个不同江段的227尾粗唇鮠为样品,采用PCR与DNA测序技术,获得7个江段粗唇鮠线粒体D-loop序列长度为666 bp,碱基T、C、A、G的平均含量为32.9％、23.3％、29.4％、14.4％,A+T(62.3％)明显高于C+G(37.7％).7个江段群体的遗传多样性处于较低水平,整个群体单倍型多样性指数为0.05224,核苷酸多样性指数为0.00011,其中,均以西江群体最高,分别为0.19951、0.00052,都柳江、柳江、郁江和左江群体最低,均为0.00000,整体呈现下游高于上游,南方高于北方的现象.NJ系统树表明本次调查的粗唇鮠群体拥有6种单倍型.群体间表现出很小的遗传分化,Fst为-0.01062～0.01977.AMOVA分析结果显示,变异几乎全部来自种群内部,其中不同江段群体间的变异占0.13％,群体内部占99.87％.动态历史分析结果表明,西江流域广西段粗唇鮠的有效种群可能是在距今0.75～1.25 Ma前由单一、少数种群所产生,西江流域粗唇鮠种群遗传多样性较低.