miR395分子进化特性及其在龙眼早期体胚发生中的表达分析

• 作者: 林玉玲 苏立遥 蒋梦琦 赖钟雄 黄倏祺
• 来源期刊: 果树学报
• 学科: 农学
• 关键词: 龙眼 miRNA395 进化特性 早期体胚发生 实时荧光定量PCR
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 所属期刊栏目: 种质资源·遗传育种·分子生物学
• 页码范围: 18-28
• 页数: 11页
• 分类号: S667.2
• 字数: 7117字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13925/j.cnki.gsxb.20190375

摘要

[目的]研究miR395的分子进化特性及其在龙眼早期体胚发生中的表达分析.[方法]通过龙眼miRNA文库、转录组数据库和miRBase数据库,得到所有植物miR395家族成员成熟体和前体序列,对其进行序列比对及进化分析、保守性分析、前体二级结构预测、潜在靶基因预测,对龙眼miR395a在龙眼早期体胚发生(SE)阶段的表达模式进行分析.[结果]龙眼miR395家族包含5条前体序列和2条成熟体序列.Mfold预测分析发现,龙眼pre-miR395序列均能形成稳定的发卡结构,其最小折叠自由能△G在-44.70～64.80 kal.mol-,提示与序列长度没有显著相关性.其次,保守性分析显示,植物pre-miR395两端序列较保守,而中间序列不保守;系统进化分析提示,龙眼pre-miR395家族与脐橙、葡萄和苹果的亲缘关系更近.psRNAtarget预测显示,龙眼miR395调控的潜在靶基因主要包含富含亮氨酸重复受体蛋白激酶LRR-RLKs、ATP硫酸化酶APS1、蛋白磷酸酶PP2C、前体RNA蛋白质TSR1同系物TSR1、酮酯酰CoA硫解酶KAT2和EH结构域蛋白EHD1等6个,且都是以裂解靶标的方式进行调控.qRT-PCR分析表明,在龙眼早期体胚发生阶段,miR395a呈上调趋势,且miR395a与APS1呈显著负相关.[结论]龙眼miR395与其他植物miR395功能具有高度保守性和物种特异性,同时龙眼miR395a上调表达可能促进龙眼球形胚的形态建成.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赖钟雄	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	473	4127	31.0	41.0
2	林玉玲	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	148	560	10.0	16.0
3	苏立遥	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	8	0	0.0	0.0
4	黄倏祺	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	5	0	0.0	0.0
5	蒋梦琦	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	5	0	0.0	0.0