三种跳虫肠道菌群的多样性分析及功能预测

• 作者: 崔薇 李娟 渠凤甜 谢桂林 赵红庆 陈伟 陈霞 马欣然
• 来源期刊: 昆虫学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 跳虫 肠道菌群 物种多样性 16S rDNA 物种注释 功能预测
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 病理与微生物
• 页码范围: 450-461
• 页数: 12页
• 分类号: Q965.8
• 语种: 中文
• DOI: 10.16380/j.kcxb.2020.04.008

摘要

[目的]跳虫在土壤生态系统中发挥着重要的作用.本研究旨在调查Sinella(Coecobrya)oligoseta,Proisotoma minuta和Tomocerus missus 3种跳虫肠道菌群的结构和多样性以及潜在功能.[方法]采用16S rDNA扩增子测序法对以上3种跳虫成虫肠道内容物中的菌群进行分析和比较;应用Tax4Fun法对其肠道菌群基因进行功能预测.[结果]3种跳虫中成虫肠道菌群多样性最高的是T.missus,最低的是S.(C.)oligoseta.在门水平上3种跳虫成虫肠道中最主要的菌群均为变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidetes),放线菌门(Actinobacteria)也具有较高的丰度;在属水平上S.(C.) oligoseta肠道中假单胞菌属Pseudomonas的丰度(16.21％)明显高于P.minuta和T.missus肠道中的丰度(分别为0.87％和1.37％);P.minuta肠道中弧菌属Vibrio的丰度(25.81％)明显高于S.(C.)oligoseta和T.missus肠道中的丰度(分别为3.35％和0.004％).另外,KEGG pathway注释预测出3种跳虫成虫肠道菌群基因功能涉及碳水化合物和氨基酸代谢、传染性疾病和耐药性.[结论]S.(C.) oligoseta,P.minuta和T.missus这3种跳虫肠道菌群在门水平上的核心菌群相同,而在属水平上的优势菌属丰度存在较大差异,其影响因素应该包括物种自身遗传特点及栖息地环境中微生物种类和数量的不同.在这3种跳虫肠道内发现放线菌,有利于新型放线菌的开发及其代谢产物的利用,并且它们的肠道内很可能存在耐药性和致病性菌株,这为跳虫肠道菌群的功能研究指引了新方向.