不同马铃薯基因型对根际细菌群落结构的影响

• 作者: 张义正 方志荣 清源 赖先军 颜朗 黄莓
• 来源期刊: 四川大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 马铃薯 根际微生物 群落多样性 高通量测序 高山地方种
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 生物学
• 页码范围: 383-390
• 页数: 8页
• 分类号: Q933
• 字数: 6343字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0490-6756.2020.02.028

摘要

本研究旨在从根际细菌群落结构的角度阐述不同马铃薯基因型对根际细菌菌群的影响,探讨高山地方种根际细菌菌群特性,挖掘可能对地方种定殖起关键作用的细菌类型.本研究通过高通量测序数据对不同马铃薯基因型根际细菌16S rRNA基因进行操作分类单位(OUT)聚类,分析样品间细菌群落的多样性特征,并通过OUT丰度差异分析揭示引起基因型效应的根际细菌类型.测序结果经质量控制,共获得3097269条高质量序列(Clean tags)并依据97％ 的序列相似性聚类到1565个有效OTUs,品种间OUT种类相差不大.群落多样性反映高山地方种乌洋芋和牛角洋芋根际细菌群落较其他基因型存在着显著差异.乌洋芋和主栽品种米拉间O T U丰度分析表明乌洋芋中55个O T U丰度上调,143个丰度下调,差异显著.本研究表明,马铃薯根际细菌群落多样性受马铃薯基因型因素的影响,高山地方种相较于自育种和主栽种其根际细菌群落结构表现出显著的差异.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张义正	四川大学生命科学学院四川省分子生物学及生物技术重点实验室	150	2059	26.0	38.0