甜橙CsHAC1基因克隆及其在响应柑橘黄龙病侵染过程中的表达

• 作者: 伍俊为 杨莉 王星淇 王梦鸽 石小保 程春振 罗彬彬 车婧如 钟云
• 来源期刊: 应用与环境生物学报
• 关键词: 甜橙 组蛋白乙酰转移酶 黄龙病 互作蛋白 表观遗传调控
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 217-225
• 页数: 9页
• 语种: 中文
• DOI: 10.19675/j.cnki.1006-687x.2019.07008

摘要

为揭示甜橙组蛋白乙酰转移酶1基因(CsHAC1)在柑橘黄龙病(HLB)侵染过程中的响应机制,利用PCR和RT-PCR分别克隆该基因gDNA和cDNA序列,并进行系列生物信息学分析.同时,还对CsHAC1互作蛋白进行预测并研究它们在感染HLB的柑橘中的表达情况.结果显示,该基因编码序列(CDS)全长为5 307 bp,预测可编码含有1 768个氨基酸、无信号肽和跨膜结构的蛋白质.亚细胞定位预测的结果显示CsHAC1主要定位在细胞核.CsHAC1含有ZnFTAZ、PHD、HAT KAT11、ZnF ZZ等多个保守结构域,蛋白互作预测结果显示CsHAC1与ZC3H19L、SUMOs和HAM1L等蛋白存在互作关系.启动子顺式作用元件预测结果显示CsHAC1启动子除含有大量光响应元件外还含有一些逆境(如低温、防御和应激、厌氧等)和激素(如脱落酸、生长素、水杨酸等)相关元件.通过分析CsHAC1及其互作蛋白编码基因在感染黄龙病的柑橘根和叶片中的表达情况发现,CsHAC1在叶片中的表达受HLB诱导,且与HAM1L的表达呈显著负相关.本研究结果表明CsHAC1可能和它的互作蛋白基因一起通过表观遗传调控参与柑橘对HLB侵染的响应.