一株塞内卡病毒A全基因组序列测定与致病性分析

• 作者: 刘小龙 刘楚楚 叶盛聪 徐磊 谭礼宁 赖隆永 邱灵姗 陈盛勇
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 塞内卡病毒A RT-PCR扩增 序列分析 遗传进化树 同源性 SVA-FJLY株 致病性
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 预防兽医
• 页码范围: 820-826
• 页数: 7页
• 分类号: S852.659.6
• 字数: 3995字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2020.04.018

摘要

本研究旨在明确塞内卡病毒A(Senecavirus A,SVA) FJLY株的基因组特性及其与其他毒株的同源性关系,并了解SVA-FJLY株的致病性.以分离自福建省某养殖场中的一株SVA-FJLY株为研究对象,参照其原型毒株SVV-001(GenBank No.DQ641257.1)全基因组序列设计5对引物,通过RT-PCR扩增、测序、拼接,获得SVA-FJ-IY株全基因组序列并进行序列分析;并通过滴鼻攻毒3～4周龄仔猪.结果 表明,SVA-FJIY株基因组全长7 275 bp(不包括PolyA),SVA-FJLY株基因组存在一个多聚蛋白、VP1蛋白和VP2蛋白.SVA-FJLY株与参考毒株之间的基因组一级结构有较高的相似性,与HeB01 2017株(MF967574.1)相似性最高,达98.5％;而与SVA原型毒株SVV-001株(DQ641257.1)的相似性较低,为93.9％.SVA-FJLY株与国内几个毒株属于同一个分支,与国内的HeB01-2017株亲缘关系最近,同时与国外Colombia-2016株(KX857728.1)的亲缘关系最近.通过动物试验发现试验组猪攻毒10 d后,试验组2/3发病,对照组3/3正常,未出现仔猪死亡.通过全基因组序列测定获得了SVAFJIY株全基因组序列并进行序列分析,明确SVA-FJIY株的基因组特性及其与其他毒株的相似性关系,了解了SVA-FJLY株的致病性,为SVA的反向遗传学和疫苗的研制提供参考依据,同时也丰富了SVA的基因组信息数据库.