云南省剑川县鼠疫疫源地分离菌株基因组多态性

• 作者: 丁奕博 张海鹏 段存娟 王鹏 石丽媛 董珊珊 谭红丽 郭英 钟佑宏
• 来源期刊: 中国人兽共患病学报
• 学科: 医学
• 关键词: 鼠疫 剑川 多位点可变数目串联重复序列分析
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 所属期刊栏目: 实验研究
• 页码范围: 20-24
• 页数: 5页
• 分类号: R378
• 字数: 3577字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2694.2019.00.180

摘要

目的 阐明云南剑川野鼠疫源地鼠疫菌种群的演化及其与云南省其他疫源地菌株之间的遗传进化关系.方法 按不同时间、不同疫点、不同分离源,随机选取24株剑川分离鼠疫菌进行研究;采用差异区段(DFR)、规律成簇的间隔短回文重复序列(CRISPRs)及多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)进行基因组多态性分析;以DFR+ CRISPRs聚类分析划分簇,再以MLVA26对簇进行聚类分析.结果 24株剑川菌株中,20株菌聚为一个簇(剑川野鼠鼠疫簇);2017年疫情分离3株菌位于丽江野鼠鼠疫簇,与丽江菌株(2017LZ)存在2个位点的差异(N2577,M23);剩余1株为一个独立株;50年代菌株与其邻近的80年代菌株间位点差异未超过3.结论 剑川原野鼠疫源地的发现时间可往前推至上世纪50年代,同时疫情还波及过家鼠和人群;剑川县境内存在2种类型的野鼠疫源地,其鼠疫防控具有复杂性,应继续加强鼠间鼠疫的动态监测.