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柚子基因组比较分析以及祖先染色体重构
柚子基因组比较分析以及祖先染色体重构
作者:
王希胤
王金朋
袁嘉庆
原文服务方:
河北农业大学学报
柚子
共线性
多倍化
片段化
染色体重构
摘要:
柚子(Citrus grandis Osbeck)全基因组测序完成为柑橘植物乃至整个芸香科植物提供了研究机会.本研究通过对柚子基因组结构分析,鉴定柚子基因组中存在的由多倍化产生的重复基因,构建了葡萄基因组和柚子基因组之间与多倍化、物种分化相关联的同源共线性基因列表,为柚子基因组进化和基因功能演化提供了重要的比较基因组学数据资源;通过与外类群葡萄保留的同源染色体区域进行比较,发现柚子基因组在多倍化之后发生了大量的片段化重组;利用葡萄基因组保留有较完整的染色体结构相对于真双子叶六倍体(ECH),结合葡萄和柚子基因组之间的同源关系,推断出柚子祖先基因组结构.本研究对理解柚子基因组乃至柑橘植物基因组以及其进化提供了重要的比较基因组学的基础.
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文献信息
篇名
柚子基因组比较分析以及祖先染色体重构
来源期刊
河北农业大学学报
学科
关键词
柚子
共线性
多倍化
片段化
染色体重构
年,卷(期)
2020,(1)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
48-54,61
页数
8页
分类号
Q949.752.7
字数
语种
中文
DOI
10.13320/j.cnki.jauh.2020.0007
五维指标
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王希胤
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王金朋
华北理工大学生命科学学院
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袁嘉庆
华北理工大学生命科学学院
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研究来源
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期刊影响力
河北农业大学学报
主办单位:
河北农业大学
出版周期:
双月刊
ISSN:
1000-1573
CN:
13-1076/S
开本:
大16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1959-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
3393
总下载数(次)
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英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
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