痤疮发病机制关键基因和通路的生物信息学研究

• 作者: 李华润 李婷 温炬 秦思 郑荣昌 黄舒婷 黄锦萍
• 来源期刊: 中华医学美学美容杂志
• 关键词: 痤疮 生物信息学 差异基因 发病机制 关键通路
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 313-317
• 页数: 5页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.1671-0290.2020.04.027

摘要

目的 通过生物信息学分析方法探讨痤疮发病机制中可能起重要作用的关键基因和通路.方法 从GEO数据库获取GSE6475和GSE53795数据集比较18个痤疮皮损组织和18个正常皮肤组织.用DAVID数据库对差异基因进行基因本体论分析和基因组百科全书关键通路分析,建立差异基因的蛋白互作网络,获取关联性最强的枢纽基因和重要的模块.结果 筛选出痤疮组织和正常皮肤组织中314个上调差异基因和62个下调差异基因.KEGG通路分析显示,这些差异基因主要富集在金黄色葡萄球菌感染、破骨细胞分化、戊糖和葡萄糖醛酸酯的相互转化、趋化因子信号途径、药物代谢-其他酶等通路中.建立的PPI网络筛选出379个节点及10个枢纽基因(CXCL8、PTPRC、IL1B、ITGB2、CXCR4、ICAM1、CCR5、SELL、C3AR1、PLEK).结论 枢纽基因和关键通路可能是痤疮发病机制中可进行干预的新靶点.