刺盘孢菌的蛋白互作预测及侵染早期共表达模块分析

• 作者: 何华勤 刘伟 张承康 翁铭铮 连玲丽
• 来源期刊: 菌物学报
• 关键词: 刺盘孢菌 蛋白互作 侵染早期 共表达模块
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 298-311
• 页数: 14页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13346/j.mycosystema.190310

摘要

刺盘孢菌是一类重要的植物病原真菌,在全球范围内危害众多单双子叶植物.有许多研究对病菌的侵染模式进行了探索,但仍未阐明其确切的分子机制.本研究在预测病菌蛋白互作的基础上,结合表达谱数据对病菌在活体生存环境下的共表达模块进行挖掘和分析,以期为分子机制的研究提供新的线索.通过同源映射法和结构域法,预测得到刺盘孢菌的4 288个蛋白之间存在41 700个潜在互作,其中39 776个互作发生于异源蛋白之间,1 924个互作发生于同一蛋白内.将蛋白互作数据分别与4个表达谱数据进行整合,构建得到离体Ⅰ、离体Ⅱ、活体Ⅰ和活体Ⅱ4个共表达互作组.对离体和活体互作组的共有基因的表达水平进行比较分析,结果表明,与离体互作组相比,活体互作组中与翻译、蛋白代谢等有关的基因表达水平下降,与离子转运、糖物质转运等有关的基因表达水平上升,暗示了物质转运在刺盘孢菌侵染早期的重要作用.进一步对活体互作组进行模块化分析,结果表明,活体Ⅰ和活体Ⅱ的特异模块分别与胁迫响应、肌动蛋白纤维长度调控有关,其中胁迫响应子网是以热激蛋白Hsp70为核心的互作簇,可能参与病菌对寄主的识别与对抗;肌动蛋白纤维长度调控子网则可能与病菌菌丝在寄主细胞间的延伸有关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	何华勤	福建农林大学生命科学学院	39	1279	17.0	35.0
2	连玲丽	福建农林大学生命科学学院	19	188	8.0	13.0
3	刘伟	福建农林大学园艺学院	41	275	9.0	14.0
7	张承康	宁德师范学院生命科学学院	2	0	0.0	0.0
8	翁铭铮	福建农林大学生命科学学院	1	0	0.0	0.0