芒果MiCOL6基因的克隆及其生物信息学和表达分析

• 作者: 何新华 余海霞 刘源 卢新喜 张秀娟 罗聪
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 芒果 CONSTANS MiCOL6 基因克隆 生物信息学分析 表达模式分析
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 生物技术与组织培养
• 页码范围: 715-721
• 页数: 7页
• 分类号: S667.7
• 字数: 4663字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2020.04.012

摘要

CONSTANS(CO)是光周期途径的核心调控因子,其可以整合光质和生物钟输出的信号调控植物成花.在前期转录组研究的基础上,设计基因特异性引物,通过RT-PCR扩增得到芒果的1个CO基因的cDNA全长,序列长度为678 bp,根据与拟南芥CO家族基因的相似性,将其命名为MiCOL6.生物信息学分析显示,该基因编码226个氨基酸,分子量为26.88 kDa,等电点为4.85,属于亲水性的非分泌蛋白.保守结构域和进化树分析显示,该基因仅含1个CCT结构域,属于CO基因家族的第4组;二级结构分析表明,该蛋白主要以无规卷曲和α-螺旋为主;亚细胞定位预测显示该蛋白定位在细胞质膜上的概率最大;不同花发育时期表达模式分析表明,MiCOL6基因在杧果的花芽分化期表达量最高.本研究结果为进一步研究芒果MiCOL6基因在芒果中的功能提供理论基础.