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摘要:
[目的]通过基因组挖掘的方法,研究红树林来源白骨壤链霉菌Streptomyces avicenniae 9-9中多环稠合大环内酰胺(PTMs)类化合物的结构多样性.[方法]通过生物信息学分析白骨壤链霉菌基因组序列,寻找PTMs类化合物的生物合成相关基因;利用UPLC-MS/MS技术对该菌的次级代谢产物进行分析.[结果]在白骨壤链霉菌基因组中发现PTMs生物合成基因簇(aviA-D);从菌液提取物中鉴定出5个PTMs类化合物,其中包括ikarugamycin(化合物1)和capsimycin B(化合物2);基于PTMs类化合物5-6-5环类型的MS/MS碎裂规律,对化合物3-5的结构进行了推测.[结论]红树林来源白骨壤链霉菌S.avicenniae 9-9具有产生5-6-5环类型的PTMs类化合物的能力.
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文献信息
篇名 红树林源白骨壤链霉菌中多环稠合大环内酰胺类化合物的结构多样性研究
来源期刊 微生物学报 学科
关键词 红树林 白骨壤链霉菌 次级代谢产物 多环稠合大环内酰胺 生物合成
年,卷(期) 2020,(1) 所属期刊栏目 研究报告
研究方向 页码范围 106-117
页数 12页 分类号
字数 语种 中文
DOI 10.13343/j.cnki.wsxb.20190102
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 徐俊 上海交通大学微生物代谢国家重点实验室生命科学技术学院 31 243 9.0 15.0
2 徐岷涓 上海交通大学系统生物医学教育部重点实验室系统生物医学研究院 3 5 1.0 2.0
3 步绪亮 上海交通大学微生物代谢国家重点实验室生命科学技术学院 2 2 1.0 1.0
4 翁静怡 上海交通大学系统生物医学教育部重点实验室系统生物医学研究院 1 1 1.0 1.0
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研究主题发展历程
节点文献
红树林
白骨壤链霉菌
次级代谢产物
多环稠合大环内酰胺
生物合成
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
微生物学报
月刊
0001-6209
11-1995/Q
大16开
北京朝阳区北辰西路1号中科院微生物所内
2-504
1953
chi
出版文献量(篇)
4459
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15
总被引数(次)
53416
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