应用于小鼠早期胚胎细胞的ChIP-seq体系中基因组水解酶的筛选

• 作者: 钟蓓 高晗
• 来源期刊: 现代畜牧科技
• 学科: 农学
• 关键词: 小鼠早期胚胎 ChIP-seq 核酸水解酶 酶切效率
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 所属期刊栏目: 研究与综述
• 页码范围: 8-11
• 页数: 4页
• 分类号: S865.1
• 字数: 2761字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19369/j.cnki.2095-9737.2020.01.003

摘要

在过去的十几年中,染色质免疫共沉淀测序技术(ChIP-seq)成为了分析表观基因组和鉴定DNA相关蛋白重要结合位点的主要技术.然而,ChIP-seq技术目前仍存在一些技术难点.其中一个重要限制是ChIP-seq需要大量的起始材料,需要至少数百万个细胞才能启动,然而实验中有两个关键步骤往往会造成所使用的样本丢失,即染色质制备和免疫沉淀.本实验通过从染色体制备入手,通过选择两种不同核酸水解酶DNase和MNase,设计不同实验组验证最佳酶切浓度,以优化ChIP-seq体系.结果 证明0.1U/μL的MNase为本实验中ChIP-seq最佳酶切浓度.结果 为ChIP-seq体系的优化提供了参考,对ChIP-seq技术在小鼠早期胚胎细胞中的应用以及发展有一定的积极意义.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	钟蓓	东北农业大学生命科学学院	3	0	0.0	0.0
2	高晗	东北农业大学生命科学学院	3	0	0.0	0.0