基于线粒体COⅠ基因序列的中国近海蓝圆鲹遗传多样性研究

• 作者: 徐示 王业磷 章群 罗纯 裴丽梅 黄志基
• 来源期刊: 海洋渔业
• 学科: 生物学
• 关键词: 蓝圆鰺 中国近海 COⅠ基因 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 129-137
• 页数: 9页
• 分类号: Q349
• 字数: 4733字
• 语种: 中文

摘要

为了解蓝圆鲹(Decapterus maruadsi)遗传多样性和种群结构,提出合理的蓝圆鲹种质资源保护依据,测定并分析了中国沿海10个地理群体193个体线粒体细胞色素C氧化酶I(COⅠ)基因序列.在652 bp的COⅠ序列中共检测到62个变异位点,29个单倍型,总体呈现较高的单倍型多样性(0.62600±0.03000)和低核苷酸多样性(0.00225±0.00116)的特点.核苷酸多样性显示:以福建海域为界北方高于南方(北方π=0.00406～0.00568,南方π=0.00017～0.00305),南海以阳江为界东部高于西部(东部π=0.00143～0.00568,西部π=0.00017～0.00286),单倍型网络图未出现明显系谱结构和地理结构.群体间遗传分化系数Fst显示,北海群体与其他群体有较高的遗传分化(Fst=0.145～0.798,P<0.001),新盈与陵水、惠来、阳江、福州和舟山样本之间也存在较高的遗传分化(Fst=0.006～0.229,P<0.05),其余群体间分化不显著.AMOVA分析表明,组群内群体间的变异比例占到16.66％～19.49％,原因可能是蓝圆鲹只作短距离洄游的生活习性以及受中国沿岸流、黑潮、暖流和北部湾特殊的大陆架的影响、北海和新盈与其他群体基因交流有限所致.蓝圆鲹整体的Fu's FS为显著性负值(FS=-1.1718,P<0.01);核苷酸错配峰图为明显单峰;单倍型网络图呈典型星状结构,表明蓝圆鲹群体经历过种群扩张.根据Bayesian skyline plot(BSP)分析扩张大约发生在0.222百万年前.北海和新盈群体与其他群体间存在较高的分化,可作为独立的管理保护单位,其中核苷酸多样性最低的新盈群体需避免遗传多样性的进一步降低;其余群体作为另一管理保护单位,其中崂山群体核苷酸多样性最高,舟山群体其次,应重点保护二者的种质遗传资源.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	章群	暨南大学生态学系	86	843	17.0	23.0
2	王业磷	暨南大学生态学系	5	6	1.0	2.0
3	徐示	暨南大学生态学系	5	6	1.0	2.0
4	裴丽梅	暨南大学生态学系	3	1	1.0	1.0
5	黄志基	暨南大学生态学系	2	1	1.0	1.0
6	罗纯	暨南大学生态学系	2	1	1.0	1.0