染色质转座酶可及性测序研究进展

• 作者: 全建平 叶勇 吴杰 吴珍芳 杨明 杨杰 郑恩琴
• 来源期刊: 遗传
• 关键词: 染色质转座酶可及性测序 染色质开放区域 Tn5转座酶 表观遗传修饰 转录因子
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 综述
• 页码范围: 333-346
• 页数: 14页
• 字数: 11873字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16288/j.yczz.19-279

摘要

染色质转座酶可及性测序(assay for transposase-accessible chromatin with high-throughput sequencing,ATAC-seq)诞生于2013年,具有比脱氧核糖核酸酶I超敏感位点测序(deoxyribonuclease I hypersensitive site sequencing,DNase-seq)和微球菌核酸酶敏感位点测序(micrococcal nuclease sequencing,MNase-seq)更快速、灵敏、简便的优点,是目前分析全基因组范围染色质开放区域的热点技术.通过该技术能获得染色质开放区域的相关信息,从而映射出转录因子等调控蛋白的结合区域和核小体定位等信息,对于研究表观遗传分子机制具有重要意义.本文比较了5种获取染色质开放区域技术的优缺点,重点介绍了ATAC-seq的原理和主要流程,描述了利用ATAC-seq技术研究染色质开放区域的发展概况以及ATAC-seq的相关应用,期望对真核生物全基因组水平的染色质开放区域研究、顺式调控元件鉴定以及遗传调控网络的解析等提供借鉴.