基于线粒体COⅠ基因的广西不同地区福寿螺遗传多态性分析

• 作者: 杨益超 王子玥 石云良 陈智平 韦尧宝
• 来源期刊: 中国热带医学
• 学科: 医学
• 关键词: 福寿螺 聚合酶链式反应 COⅠ基因 序列分析 广西
• 年，卷（期）: 2020,（7）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 645-648
• 页数: 4页
• 分类号: R532.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.13604/j.cnki.46-1064/r.2020.07.14

摘要

目的 通过对广西不同地区福寿螺的CO Ⅰ基因进行分析,以了解广西福寿螺种群的遗传多态性.方法 从南宁市横县、桂林市全州县和荔浦县、贺州市富川县、百色市田林县和崇左市凭祥县共计6个县区采集福寿螺样本,提取DNA并进行CO Ⅰ基因的PCR扩增及测序.运用MAGE 7.0将本研究获得的单倍型与GenBank中的福寿螺单倍型使用邻接法构建系统进化树,并计算个体间的遗传距离,分析其遗传多样性.结果 CO Ⅰ基因长度为493 bp,从11个样本鉴定出2种单倍型:单倍型1(Haplotype 1)和单倍型2(Haplotype 2).其中9个样本为Haplotype 1,分别来源于南宁市横县(2个)、贺州市富川县(1个)、桂林市荔浦县(1个)、百色市田林县(2个)、崇左市凭祥县(3个),该单倍型与小管福寿螺遗传距离最近,为0.047;2个样本为Haplotype 2,分别源自为南宁市横县和桂林市全州,与孤岛福寿螺遗传距离最近,为0.062.根据上述条件所构建的进化树形成了7个分支,分别为P.canaliculata、P.camena、P.insularum、P.paludosa、P.diffusa、P.haustrum、和外群Pilaconica.Haplotype 1与来自美国夏威夷(GenBank登录号EU 523129)的P.canaliculata组成一个分支,Haplotype 2与来自巴西(GenBank登录号EF514942)的P.insularum组成一个分支,且置信值均在98％以上.结论 初步判断广西地区存在小管福寿螺与孤岛福寿螺两种类型的福寿螺,其种群内没有发现遗传分化.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈智平	广西医科大学公共卫生学院	51	206	7.0	11.0
2	杨益超	广西壮族自治区疾病预防控制中心寄生虫病防制所	49	233	8.0	13.0
3	王子玥	广西医科大学公共卫生学院	3	0	0.0	0.0
4	石云良	广西壮族自治区疾病预防控制中心寄生虫病防制所	7	7	2.0	2.0
5	韦尧宝	广西壮族自治区疾病预防控制中心寄生虫病防制所	2	0	0.0	0.0