结直肠癌中LncRNA介导的内源性竞争性RNA调控网络

• 作者: 喻明霞 李胜 柳家翠 邓巧玲
• 来源期刊: 西部医学
• 学科: 医学
• 关键词: 结直肠癌 TCGA 肿瘤标志物 内源性竞争性RNA
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 基础医学研究
• 页码范围: 166-170
• 页数: 5页
• 分类号: R735.3|R730.43
• 字数: 3340字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-3511.2020.02.003

摘要

目的 构建结直肠癌RNA调控网络,探讨结直肠癌中分子调控机制.方法 从TCGA数据库中提取结直肠癌转录水平表达数据,筛选差异表达RNAs,结合miRDB,miRcode,miRTarBase和TargetScan数据库靶基因预测结果,整合LncRNA-miRNA、miRNA-mRNA关系对,基于ceRNA假说及LncRNA细胞内定位,筛选出胞质表达并介导该网络调控的LncRNA,重建结直肠癌中lncRNA-miRNA-mRNA作用网络.结果 在结直肠癌差异表达基因分析中初步筛选出119个LncRNA、32个miRNA以及59个mRNA;识别777对LncRNA-miRNA与77对miRNA-mRNA,基于ceRNA假说以及LncRNA在细胞内定位,最后筛选出15个上调LncRNA、3个下调miRNA(hsa-mir-145,hsa-mir-193b,hsa-mir-150)以及5个上调mRNA重建ceRNA网络.结论 成功构建结直肠癌中LncRNA介导调控的ceRNA网络,识别出预后相关的潜在靶点,为结直肠癌治疗研究提供了新的参考依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	喻明霞	武汉大学中南医院检验科	24	85	4.0	8.0
2	邓巧玲	武汉大学中南医院检验科	8	14	2.0	3.0
3	柳家翠	武汉大学中南医院检验科	4	0	0.0	0.0