家兔前体脂肪细胞分化不同时期基因表达谱分析

• 作者: 任安勇 吴雪梅 李庆玲 杜坤 毛初阳 赖松家 陈仕毅 陈婷婷
• 来源期刊: 遗传
• 关键词: 脂肪细胞 分化 家兔 前体脂肪细胞 RNA-seq
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 309-321
• 页数: 13页
• 字数: 7966字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16288/j.yczz.19-265

摘要

脂肪的过度积累严重危害人类健康.前体脂肪细胞分化是脂肪发育的关键过程,研究前体脂肪细胞分化相关基因的表达有助于认识脂肪沉积的机理.尽管家兔是一种理想的研究脂肪发育的动物模型,但是针对其前体脂肪细胞分化不同时期基因表达谱的研究鲜见报道.本研究通过诱导家兔前体脂肪细胞分化,在分化第0 d、3 d和9 d收集脂肪细胞,利用转录组测序(RNA-seq),在分化第3 d样本与第0 d样本的比较中筛选出1352个差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),在分化第9 d样本与第3 d样本的比较中筛选出888个DEGs.GO(gene ontology)功能富集和KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes)通路分析发现,0～3 d分化期上调的DEGs显著富集在PPAR信号通路和PI3K-Akt信号通路上,3～9 d分化期上调的DEGs显著富集到与细胞周期调控有关的GO条目和KEGG信号通路,0～3 d和3～9 d阶段特异上调的DEGs可能分别作用于细胞质和细胞核.通过DEGs的蛋白-蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络分析发现,筛选出的核心节点(hub node)基因可能通过调控细胞周期而影响家兔前体脂肪细胞分化.