主养草鱼池塘中氨氧化古菌的多样性和种群分布

• 作者: 代梨梨 刘承情 宋超峰 彭亮 李晓莉 李谷 陶玲
• 来源期刊: 淡水渔业
• 学科: 农学
• 关键词: 草鱼(Ctenopharyngodon idellus) 养殖池塘 沉积物 水体 氨氧化古菌
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 页码范围: 79-86
• 页数: 8页
• 分类号: S959
• 字数: 4551字
• 语种: 中文

摘要

为了解淡水养殖池塘环境中氨氧化古菌的多样性和种群分布,本研究以荆州地区风生水起生态农场的主养草鱼(Ctenopharyngodon idellus)池塘为研究对象,采集不同养殖区的典型的沉积物样品和水样,利用AOA氨单加氧酶(amoA)基因通用引物(amoAF/amoAR)扩增amoA基因,构建amoA基因克隆文库.从每个克隆文库中随机挑选阳性克隆子进行测序、比对,利用MEGA和MOTHUR软件构建amoA基因系统发育树和可操作分类单元(OTU)分析.结果显示:主养草鱼池塘水体和沉积物中AOA存在着差异,且沉积物中AOA种类数和多样性都更为丰富.从三个采样区域的沉积物和水体共325个AOA amoA基因阳性克隆中得到24个OTU(基于3％差异度),其中水体克隆文库中得到13个OTU,沉积物克隆文库中得到18个OTU.OTU01、OTU02、OTU05、OTU07、OTU11、OTU13、OTU16是沉积物和水体中共有的OTU,并且OTU01、OTU02是养殖池塘中的优势类群,分别占克隆子的47.38％和21.84％.系统发育分析表明,AOA主要隶属于Nitrosospha-era sister group、Nitrososphaera cluster、Nitrosopumilus cluster,并且OTU01、OTU02均属于Nitrososphaera sister group.主养草鱼池塘沉积物和水体中的AOA存在差异,且在沉积物中更为丰富,主要类群为Nitrososphaera sister.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陶玲	中国水产科学研究院长江水产研究所	25	176	8.0	12.0
2	李晓莉	中国水产科学研究院长江水产研究所	27	205	10.0	13.0
3	彭亮	中国水产科学研究院长江水产研究所	6	14	2.0	3.0
4	代梨梨	中国水产科学研究院长江水产研究所	4	1	1.0	1.0
5	刘承情	中国水产科学研究院长江水产研究所	1	0	0.0	0.0
9	宋超峰	中国水产科学研究院长江水产研究所	3	1	1.0	1.0