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山羊APOE基因克隆及组织细胞表达模式分析
山羊APOE基因克隆及组织细胞表达模式分析
作者:
张亚楠
朱江江
杜宇
林亚秋
王永
许晴
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
山羊
APOE
克隆
组织表达
时序表达
摘要:
旨在克隆山羊载脂蛋白E(Apolipoprotein E,APOE)基因序列并进行生物信息学分析,明确APOE基因在山羊各组织及分化前后脂肪细胞中的表达模式,利用RT-PCR及3'RACE方法克隆山羊APOE基因序列,利用实时荧光定量PCR(Real-time quantitative PCR,qPCR)方法检测该基因在山羊心、肝、脾、肺、肾、肌肉、脂肪等13个组织中的表达水平以及在皮下前体脂肪细胞成脂分化过程中的表达变化情况.结果表明,RT-PCR方法获得山羊APOE基因序列970 bp,其中ORF 951 bp,5'UTR 7 bp,3'UTR 12 bp(GenBank登录号:MN049956);3'RACE法获得3'UTR 152 bp(登录号:MN049957);Targetscan和Mirbase预测得知miR-22-3p可能靶标山羊APOE基因;蛋白预测显示山羊APOE编码316个氨基酸,是一个具有信号肽、无跨膜结构域的不稳定酸性蛋白;亚细胞定位结果发现APOE在细胞外、细胞质、液泡、细胞核以及内质网中均发挥生物学作用;进化树显示该基因在各物种的同源性较高,与绵羊、藏羚羊和牛的亲缘关系最近;基因组织表达谱显示山羊APOE在皮下脂肪中的表达量最高,极显著高于其他组织(P<0.01);时序表达结果显示随着皮下前体脂肪细胞分化的进行,APOE基因表达呈上升趋势且在诱导分化60 h时表达量最高.结果为最终进一步揭示APOE基因在脂肪细胞分化、脂肪沉积及脂质代谢中的作用提供了基础理论数据.
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文献信息
篇名
山羊APOE基因克隆及组织细胞表达模式分析
来源期刊
华北农学报
学科
农学
关键词
山羊
APOE
克隆
组织表达
时序表达
年,卷(期)
2020,(3)
所属期刊栏目
畜牧·兽医
研究方向
页码范围
217-224
页数
8页
分类号
Q78|S826
字数
5733字
语种
中文
DOI
10.7668/hbnxb.20190578
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研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
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期刊影响力
华北农学报
主办单位:
河北
北京
天津
山西
河南
内蒙古六省市农科院农学会
出版周期:
双月刊
ISSN:
1000-7091
CN:
13-1101/S
开本:
大16开
出版地:
石家庄市和平西路598号
邮发代号:
18-10
创刊时间:
1986
语种:
chi
出版文献量(篇)
6276
总下载数(次)
4
总被引数(次)
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