表型特征结合基因组分析鉴定不同菌落形态Bacillus velezensis ACCC 19742

• 作者: 何山文 张晓霞 王星 郭鹤宝
• 来源期刊: 生物技术通报
• 关键词: 解淀粉芽孢杆菌 形态变异型 全基因组测序 贝莱斯芽孢杆菌
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 142-148
• 页数: 7页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2019-0750

摘要

在中国农业微生物菌种中心(ACCC)菌株的定期转接保藏过程中,发现解淀粉芽孢杆菌ACCC 19742在同一培养基上出现两种不同的菌落形态,将这两个不同形态的菌株编号为19742-1和19742-2.通过形态学、生理生化及基因组分析相结合鉴定不同菌落形态ACCC 19742,并进一步确定该菌株的分类地位.首先将菌株进行分离与纯化,其次将纯化后的菌株进行16S rRNA及gyrB基因扩增及序列分析,通过MEGA 7.0软件构建系统发育树;API 20NE、BIOLOG及脂肪酸等分析菌株的生理生化特性;全基因组分析菌株的ANI和DDH值.两株菌在API 20NE中,仅葡萄糖酸盐同化反应存在差异;脂肪酸检测中主要组成相同,仅是百分含量方面略有差别;两株菌的16S rRNA基因相似性为100％,gyrB基因的相似性为99.4％;全基因组测序表明,两株菌的ANI值为99.95％,DDH值为99.62％.综合遗传学特征和表型特征,证实两者为来源于同一菌株不同的形态变异型,而并非污染所致.同时,19742-1和19742-2与Bacillus velezensis NRRL_B 41580T的ANI及DDH值最高,分别为97％和77％,且16S rRNA和gyrB系统进化分析也表明,该菌株在分类地位上属于贝莱斯芽孢杆菌(Bacillus velezensis),而非解淀粉芽孢杆菌.这为菌株的保藏提供了一定的参考价值.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王星	中国农业科学院农业资源与农业区划研究所农业农村部农业微生物资源收集与保藏重点实验室	11	83	5.0	9.0
2	张晓霞	中国农业科学院农业资源与农业区划研究所农业农村部农业微生物资源收集与保藏重点实验室	21	419	12.0	20.0
3	郭鹤宝	中国农业科学院农业资源与农业区划研究所农业农村部农业微生物资源收集与保藏重点实验室	1	0	0.0	0.0
4	何山文	中国农业科学院农业资源与农业区划研究所农业农村部农业微生物资源收集与保藏重点实验室	1	0	0.0	0.0