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摘要:
基于16S rRNA基因测序技术对24份东北马鹿冬季粪便中细菌的结构和多样性进行分析,试图揭示东北马鹿冬季肠道微生态,为该物种保护提供新的见解.结果表明东北马鹿粪便样品中菌群分属于21门33纲74目131科306属,在门水平上,马鹿肠道菌群主要由厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidete)构成,相对丰度分别为79.43%和6.64%;在属水平上,马鹿肠道菌群主要由Ruminococcaceae_UCG-005和Christenseenel-laceae_R-7_group构成,相对丰度分别为21.51%和7.56%.以97%的序列一致性为划分标准进行聚类得到2220个OTUs,雄性样本中共有1873个OTUs,雌性样本中共有2143个OTUs,其中77个OTUs为雄性样本所特有,347个为雌性样本所特有.对比不同性别东北马鹿肠道菌群,通过LEfSe多级物种差异判别分析,丰度具有显著性差异的菌类包括:Sphingomonadales目、Kaistiaceae科、Sphingomonadaceae科、Muribaculaceae科、Xanthobacteraceae科、Defluviitaleaceae科、Kaistia属、Papillibacter属、Sphingomonas属、Alloprevotella属、GWE 2_31_10、Defluviitaleaceae_UCG_011、Eubacterium_rumi-nantium_group.
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文献信息
篇名 内蒙古赤峰地区东北马鹿(Cervus elaphus xanthopygus)冬季肠道微生物多样性研究
来源期刊 野生动物学报 学科
关键词 东北马鹿 冬季 肠道微生物 多样性
年,卷(期) 2020,(2) 所属期刊栏目 研究论文
研究方向 页码范围 261-271
页数 11页 分类号 Q93
字数 语种 中文
DOI
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 张明海 东北林业大学野生动物与自然保护地学院 116 1154 19.0 28.0
2 郭金昊 东北林业大学野生动物与自然保护地学院 1 0 0.0 0.0
3 袁子奥 东北林业大学野生动物与自然保护地学院 3 1 1.0 1.0
4 张玮琪 东北林业大学野生动物与自然保护地学院 12 28 4.0 5.0
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东北马鹿
冬季
肠道微生物
多样性
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1979-01-01
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